张莉研究员介绍，驴是草食动物，属马科家畜，是肉食、阿胶、奶制品及驴副产品等的重要来源，在精准扶贫和乡村振兴中发挥着重要作用。但驴产业发展始终受到养殖科技水平低、育种体系不完善等问题的制约。本研究以德州驴2个品系的背最长肌和臀肌为研究对象进行lncRNA建库测序，共获得24,683个基因和49,265条转录本，经过比对共鉴定到3869个新的lncRNA。经过不同组间的比较分析获得了差异表达的lncRNA，并构建了lncRNA-miRNA-mRNA相互作用网络，发现了3个重要的关键候选lncRNA（MSTRG.9787.1, MSTRG.3144.1, MSTRG.9886.1）和4个关键候选基因（ACTN1, CDON, FMOD, BMPR1B）。通过KEGG生物信息学分析，发现TGF-β信号通路在德州驴肌肉发现中发挥重要作用。该研究为提高驴养殖效率、培育肉用驴新品种、促进驴产业转型升级提供了重要支撑。
相关研究成果发表在《基因 （genes）》（IF=“3.759）。硕士生石田培和助理研究员胡文萍为论文的共同第一作者，张莉研究员为通讯作者。该研究得到了院企合作研发项目《东阿黑驴重要经济性状功能基因挖掘与鉴定》（2016-YF-05）的支持。
原文链接：https://www.mdpi.com/2073-4425/11/5/508
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